Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SS18Q15532 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SS18Q15532 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SS18Q15532 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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