Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
R3HDM1Q15032 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms