Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms