Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ITGA9Q13797 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms