Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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