Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms