Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHAF1BQ13112 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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