Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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