Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHF8Q9UPP1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHF8Q9UPP1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms