Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRBP1Q9P2E9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRBP1Q9P2E9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms