Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM7Q9NQW5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms