Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms