Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP4AQ9BY43 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP4AQ9BY43 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms