Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAGR1Q9BTK6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms