Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-CQ95604 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms