Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp27Q8CEG8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms