Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT28Q7Z3Y7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms