Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC18Q5T9S5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms