Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTLL9Q3SXZ7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms