Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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KRTAP21-3Q3LHN1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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