Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NCOA1Q15788 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
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