Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms