Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXCL9Q07325 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms