Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAX8Q06710 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX8Q06710 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms