Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UTRNP46939 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UTRNP46939 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UTRNP46939 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UTRNP46939 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UTRNP46939 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UTRNP46939 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms