Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms