Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24BO95487 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms