Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KA4O75676 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms