Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUBNO60494 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUBNO60494 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms