Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYSRT1A8MQ03 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms