Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms