Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms