Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP13-3Q3SY46 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms