Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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FXNQ16595 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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