Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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