Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SS18Q15532 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SS18Q15532 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SS18Q15532 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SS18Q15532 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SS18Q15532 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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