Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SYCP1Q15431 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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