Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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NCOA4Q13772 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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NCOA4Q13772 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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NCOA4Q13772 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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NCOA4Q13772 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NCOA4Q13772 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NCOA4Q13772 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NCOA4Q13772 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NCOA4Q13772 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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