Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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