Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms