Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHAF1AQ13111 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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