Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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IFT88Q13099 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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