Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FOSBP53539 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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FOSBP53539 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOSBP53539 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
FOSBP53539 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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