Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRGP23470 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms