Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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PTPRBP23467 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRBP23467 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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