Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms