Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NRF1Q16656 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms