Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RYR3Q15413 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RYR3Q15413 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms