Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ALCAMQ13740 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms