Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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